دانشكده فیزیک به عنوان اولین دانشکده دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه در راستای هدف اصلی دانشگاه برای پیشرفت دانش در زمینه علوم پایه، در بهار ۱۳۷۲ با پذیرش دانشجو در مقطع كارشناسی ارشد کار خود را آغاز کرد. در سال ۱۳۷۵، دوره دکتری فیزیک با پذیرش اولین دانشجویان در شاخه‌های ماده چگال نظری، اخترفیزیک و فیزیک‌ریاضی راه‌اندازی شد. به فاصله کمی دوره کارشناسی ارشد در شاخه اپتیک تجربی ایجاد شد. در سال ۱۳۷۹ دوره ویژه دکتری پیوسته برای دانش‌آموزانی که رتبه‌های برتر در آزمون سراسری ورودی دانشگاه‌ها داشتند، راه‌اندازی شد. دانشجویان پذیرفته‌شده در این دوره هفت ساله، بعد از گذراندن درس‌های کارشناسی و تکمیلی، بدون انجام پروژه کارشناسی ارشد مستقیماً شروع به انجام پروژه دکتری خود می‌کنند. همچنین در سال ۱۳۹۷ دوره دکتری مستقیم از مقطع کارشناسی به دکتری تأسیس شده است.

دانشکده فیزیک محیطی پویا برای آموزش جامع در سطح تحصیلات تکمیلی فیزیک و کشف و پژوهش برای دانشجویان فراهم كرده است كه در بین دانشگاه‌های کشور منحصربه‌فرد بوده و از جنبه جهت‌گیری کاملاً علمی‌-پژوهشی و فارغ بودن از مسائل حاشیه‌ای متداول در دانشگاه‌های بزرگ شور، قابل ‌مقایسه با مراکز علمی در کشورهای صنعتی است. اعضای هیئت علمی غالباً پژوهشگران جوان فعالی هستند که در کنار اعضای باتجربه دانشکده و با همکاری نزدیک دانشجویان به پژوهش در شاخه‌های نظری و تجربی فیزیک مشغول هستند.

در حال حاضر دانشکده دارای ۳۴ عضو هیأت علمی و بیش از ۳۰۰ دانشجو در مقاطع مختلف است. دانشکده با دارا بودن نسبت بسیار بالای استاد به دانشجو در بین دانشگاه‌های کشور کم‌نظیر است. همچنین این دانشکده از نظر نسبت تعداد مقالات باکیفیت به تعداد اعضای هیأت علمی همواره یکی از بهترین‌ها در سطح کشور بوده است.

فعالیت‌های ما در دانشکده فیزیک منجر به ثبت اختراعات متعددی متناسب با نیازهای داخلی کشور و همچنین چاپ مقالات در مجلات معتبری مانند نیچر و فیزیکال ریویو و غیره شده است. موضوعات مختلفی مانند اپتیک کلاسیک و کوانتومی، سیستم‌های پیچیده، کیهان شناسی و فیزیک کهکشان ها، ماده‌ی نرم و فیزیک زیستی، و مواد کوانتومی از جمله مباحث اصلی تحقیقاتی هستند که در دانشکده فیزیک دنبال می‌شوند. تاکنون بیش از 900 دانشجوی کارشناسی ارشد و دکترا از گروه فیزیک فارغ التحصیل شده‌اند که بسیاری از آنها در حال حاضر تحصیلات خود را ادامه می‌دهند یا در مراکز تحقیقاتی معتبر دنیا مشغول به فعالیت هستند و این گواهی برای کیفیت بالای برنامه‌های آموزشی و تحقیقاتی در این دانشکده است.